依据微生物实验室的安全性规定和应用规定，要有别于一般的实验室工程项目或洁净工程。关键运用于微生物学、生物医学工程、细胞生物学、临床实验、基因重组及其医疗器械等科学研究应用的实验室通称微生物洁净实验室。
微生物洁净实验室主洁净实验室开创一区，分配在实验室的靠右边角落处。用气密门限定工作人员的出入，把有洁净规定的屋子设定在工作人员影响少的地区，把辅助屋子设定在外界。考虑到微生物实验操作步骤，把检验室与刷洗消毒室和塑造室邻近，便捷人工流产与货运物流的分离出来。
微生物洁净实验室分成一级、二级、三级、四级，习惯性上称之为P1、P2、P3、P4。二级院内感染实验室对身体、动物与植物或自然环境具备中等水平伤害或具备潜在性发病因素，对身心健康成年人、小动物和自然环境不容易导致严重威胁，具备合理的防止和**措施。